Como una respuesta a la creciente demanda de servicios de gestión tecnológica, en 1987 la Dirección del ahora Instituto, con el apoyo del Centro para la Innovación Tecnológica, creó el Núcleo de Innovación Tecnológica que junto con los núcleos de otras dependencias formó la Red de Núcleos de Innovación. Atendiendo la necesidad de profesionalizar la gestión de otros apoyos a la comunidad del Instituto, en 1992 el núcleo se transforma en la actual Secretaría Técnica, cuyo objetivo general es el dar apoyo a la comunidad académica del Instituto de Biotecnología en las siguientes áreas:

1. Apoyo a la producción de tecnología biológica competitiva, mediante la protección de los derechos de propiedad industrial de los desarrollos generados, promoviendo y facilitando la vinculación con el sector productivo;
2. Apoyo a la generación de conocimiento, mediante la gestión de financiamiento para los proyectos de investigación y desarrollo;
3. Apoyo a la consolidación del personal académico, por medio de la gestión de financiamiento para realizar estancias fuera del Instituto y;
4. Apoyo al crecimiento de la comunidad académica, a través de la incorporación de nuevos investigadores.

Entre las principales gestiones realizadas durante 2009 están: El otorgamiento de licencias para tres tecnologías propiedad de la UNAM. La redacción y realización de gestiones para la presentación de 3 nuevas solicitudes nacionales de patente y 19 de fase nacional de 2 solicitudes internacionales (PCT). Así mismo, la gestión para el otorgamiento de 1 patente mexicana. La negociación, estructuración, elaboración y firma de 16 nuevos convenios o instrumentos consensuales con empresas e instituciones nacionales y extranjeras para la realización de proyectos de Investigación y desarrollo, así como de otros 19 convenios de transferencia de materiales biológicos, confidencialidad o licencia de software especial. La presentación de 107 solicitudes de apoyo a proyectos de investigación individual y conjunta, a estancias de investigación y a organización de eventos académicos, ante el CONACyT, la DGAPA/UNAM y diversos organismos nacionales e internacionales, formalizándose 107 apoyos. La gestión de 24 trámites migratorios en apoyo al personal académico extranjero del Instituto.